芽孢桿菌有不同種，同一種又有不同菌株，作用效果大不同，就像人類是同「種」，但又有黑人、白人、黃種人等等的分別，科學家最重要的工作，就是採集環境中的芽孢桿菌，分離出對人類最有用的菌株，大量生產，目前農業界使用最廣泛的，就數枯草桿菌和液化澱粉芽孢桿菌。

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